El estudio estuvo enfocado a obtener información especializada de la diversidad genética del cacao (nativo y/o introducido), que están adaptados a nichos ecológicos específicos de distintas regiones del país y discriminar sus atributos fenotípicos y genotípicos a través de métodos estandarizados de caracterización fenotípica (“descriptores morfológicos”), y moleculares (ISSR), denominado inter-microsatélites, muy utilizados en investigaciones acerca de la diversidad genética del cacao.